I förbundsfullmäktige avgörs alla viktiga frågor under kongressperioden. Fullmäktige samlas i regel till två möten per år, ett höstmöte och ett vårmöte.

Medan FSL bevakar lärarnas intressen nationellt, är det lärarföreningarna som samlar regionens lärare och sköter den lokala verksamheten.

På varje ort där en av FSL:s medlemsföreningar verkar finns en förtroendeman som övervakar att skolor och kommuner följer de lagar och avtal som reglerar lärarnas anställningsförhållanden.